L'Ecole doctorale est dotée de trois commissions :


* Une Commission administrative, composée de quatre membres et dont la fonction principale est de gérer au quotidien les activités scientifiques de l'Ecole doctoralee.

* Une Commission scientifique, qui est l'équivalent du Conseil scientifique de l'Ecole

* Une Commission pédagogique, composée des coordinateurs des différents mastères et dont la fonction principale est d'élaborer les actions de formation dans le cadre des grandes orientations prises par la Commission scientifique.